LSAC生命科技论坛:高通量测序技术与应用

E1馆二楼,M16会议室

2018LSAC生命科技论坛与analytica China展览同期召开。生物谷与慕尼黑展览(上海)有限公司作为2018LSAC生命科技论坛共同主办单位,双方将共同邀请行业人士围绕高通量测序技术与应用,从政策方向、新技术、投融资趋势等多角度展开深入探讨,以期为行业从业者间架起充分沟通的桥梁。

会议时间:

2018年11月01日 

 

会议地点 :

上海新国际博览中心

E1馆二楼,M16会议室

 

主办单位  Organizers:

生物谷  Bioon.com

慕尼黑展览(上海)有限公司 Messe Muenchen Shanghai Co., Ltd.

 

会议主题 :

高通量测序技术与应用 

 

参会对象:

基因测序、诊断检测企业高管;科研院所专家学者;仪器设备商;制药企业市场、科研人员等

 

会议语言:

英语或中文 

 

会议内容:

政策方向

国内外基因测序政策发展趋势

基因检测市场标准与规范性

国内基因测序监管政策

新技术发展

高通量测序平台及方法比较(RNA测序、全基因组测序、深度测序、miRNA测序、DNA测序、靶向测序、深度测序、重测序等)

单细胞测序、单分子测序技术及其应用

高通量测序信息分析解读、数据挖掘

应用热点领域

高通量测序与液体活检、癌症筛查

基于高通量测序的健康管理

高通量测序个性化医学和临床分子诊断

未来发展趋势

全球高通量测序市场发展与趋势

高通量测序生物信息学解决方案

 

  • 高通量测序技术与应用

时间 演讲题目 演讲嘉宾
时间 演讲题目来宾入场 演讲嘉宾

时间 演讲题目主办方致辞 演讲嘉宾

时间 演讲题目高通量组学技术与表观遗传分析 演讲嘉宾

王德韬
上海伯豪生物技术有限公司

时间 演讲题目高通量测序建库技术与应用 演讲嘉宾

杨毅
纽英伦生物技术(北京)有限公司 运营&技术总监

时间 演讲题目高通量测序技术在单细胞组学分析与应用 演讲嘉宾

黄健
上海交通大学系统生物医学研究院

时间 演讲题目午餐午休 演讲嘉宾

时间 演讲题目基于CTC的单细胞测序数据分享及应用展望 演讲嘉宾

成璐
格诺生物科技(中国)有限公司 首席医学官

时间 演讲题目New Developments in NGS sample Quality Control – from FFPE RNA to cell-free DNA 演讲嘉宾

Rainer Nitsche
安捷伦科技(中国)有限公司 生物分子分析事业部全球产品经理

时间 演讲题目茶歇 演讲嘉宾

时间 演讲题目中国基因数据与决策网络 演讲嘉宾

李奇
上海其明信息技术有限公司 CEO

时间 演讲题目CTC液体活检与伴随诊断一体化临床应用进展 演讲嘉宾

亓立峰
无锡纳奥生物医药有限公司 董事长

时间 演讲题目自由交流与讨论 演讲嘉宾

  • Rainer Nitsche

    安捷伦科技 | 生物分子分析事业部全球产品经理

    Rainer Nitsche,全球产品经理,安捷伦生物分子分析事业部
    Rainer是安捷伦生物分子分析事业部市场部全球产品经理,安捷伦生物分子分析事业部设在德国Waldbronn。Rainer负责新一代TapeStation仪器系统的市场推广。他与德国卡尔斯鲁厄大学生物化学系获得博士学位,专业为化学与生物化学。

    二代测序样本质控新发展——从FFPE DNA到cfDNA

    在过去的数年间,二代测序(NGS)在几乎所有的遗传研究和诊断领域发展成为了一个强大的工具。而任何NGS实验成功的关键是初始RNA和DNA样本以及它们所生成的文库的质量控制(QC)。大多数的文库制备工作仍然非常冗长,可谓是昂贵的步骤。为了避免“垃圾进垃圾出”的情况,需要严格的质控步骤。理想的NGS质控步骤应该是易于操作、经济 ,并且对于非常低浓度的样品也能够提供快速且无争议的结果。 确保样品“满足目标用途”的一种方法是应用自动化的电泳分离,并进行荧光检测和自动数据分析。该报告包括了NGS样本质控的最新发展,并给出实际应用案例。
    从血液样本(“液态活检”)或其他体液中提取的无细胞DNA(cfDNA)在癌症研究和产前检测中变得越来越重要。准确地定量cfDNA样品对于确定测序前cDNA文库制备时合适的DNA用量是必不可少的。基于不同的样品处理或提取方法,cfDNA样品中可能含有较大的DNA片段,例如基因组DNA污染。高分子量的物质会对文库的制备产生负面影响,从而导致测序深度较低。报告中将展示不同cfDNA样品的案例并讨论其数据。

  • 李奇

    上海其明信息技术有限公司 | CEO

    现任上海其明信息技术有限公司CEO, 毕业于复旦大学, 2005年创建中国首家基因生物信息企业,并于2015年创建中国第一个基因云计算系统GCBI(Gene Cloud of Biotechnology Information)。GCBI运营3年来,已成为年使用量达到500万人次/年的基因搜索与计算平台,每年有40万医学用户在线使用,涉及医疗机构3000多家。在李奇的领导下,其明公司成为两项国家科技部精准医疗计划的执行单位,分别为“基于远程/移动医疗网络的精准医疗综合服务示范体系建设与推广”和“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”,成为一项上海市发改委服务业平台建设单位,为“其云基因大数据知识库”。李奇作为作者之一的多篇生物信息成果发表于 Science、Nature Communication、Cancer Cell 等研究期刊。

    中国基因数据与决策网络

    在9月底结束的中国临床肿瘤大会上,其明公司对基因测序在肿瘤诊疗中的地位和困境做了一份调查。调查意在发现高通量测序对肿瘤诊疗发挥作用的期望和障碍。调查面涉及到110家肿瘤诊断产品公司和医疗服务机构。我们发现,肿瘤诊断对高通量测序的期望在不断增大,但是高通量测序的价值却严重受限于其数据规模。从基因及其变异视角来看,每个个体都是特殊事件,千万种特殊汇总成为总体的普遍特征,从而使人群可以按基因特征归类和预测。若想实现基于基因数据的健康评估、诊断、预后预测,只有在汇集大量完全个体化离散的基因数据后才能实现。此外,仅有基因数据还无法对肿瘤诊疗进行决策。基因数据本身并不产生价值。基因数据还必须与深厚广泛的医学知识融合,才能具有决策能力。所以发现基因变化、存储基因变化、理解基因变化、应用变化的信息指导诊疗决策。这样才是完整的整体机制。而今天,我在此要向大家讲述的就是这么一个完整体系,中国GCBI——中国生物信息基因云。

  • 王德韬

    上海伯豪生物技术有限公司 | 产品经理

    王德韬博士,上海伯豪生物技术有限公司产品经理。上海大学生物信息工程博士,主要研究领域:非小细胞肺癌中miRNA调控网络的研究;miRNA转录调控机制研究;黏细菌次级代谢产物抑菌抑癌的研究;非编码RNA(tRNA)潜在调控机制的研究;肿瘤的表观遗传学。参与多项973项目、国自然项目等关于miRNA的功能研究、miRNA调控网络的研究。在表观遗传学项目经验丰富,服务项目数超过200个,协助客户完成在JCO,NC等期刊发表文章。建立了甲基化芯片DMR分析的方法和甲基化与miRNA启动子区域联合分析的方法。

    高通量组学技术与表观遗传分析
  • 杨毅

    纽英伦生物技术(北京)有限公司 | 运营总监

    1995年在澳大利亚悉尼The University of New South Wales获博士学位。在美国哈佛大学从事博士后研究工作期间,首先克隆并研究出一种信号转导蛋白-Ras Guanine Nucleotide Releasing Protein,该蛋白质与肥大细胞的分化与功能密切相关。杨毅博士现任NEB(北京)运营&技术总监

    高通量测序建库技术与应用

    Next generation sequencing continues to revolutionize genomic research. Lower input material and higher throughput requirements are ever growing demands for library preparation methods used to study the genome and transcriptome. Highly streamlined, efficient, robust and reliable methods are required to ensure high quality data generation, including high yields, high coverage, low GC bias, and sensitivity.

    To address these challenges, we continue to develop a broad range of solutions for sample preparation using multiple sample types. These include a novel enzymatic DNA fragmentation reagent incorporated into DNA library preparation workflow that uses a single time-dependent protocol, regardless of input amount and GC content. This reliable fragmentation reagent is also combined with end repair and dA-tailing agents, thereby eliminating the need for equipment to shear DNA, and reducing the number of sample transfers and losses. Adaptor ligation is also carried out in the same tube, followed by a single cleanup step. For low input samples, PCR amplification is performed prior to sequencing. These optimizations enable a more streamlined, automation friendly workflow using low input DNA without compromising on data quality.
    RNA sequencing (RNA-seq) has become the tool of choice for transcriptome profiling and discovery. To meet the need for RNA library construction methods that produce high quality, reproducible libraries from small amounts of precious material we have developed two streamlined RNA-seq library preparation methods that can be used across a wide range of input RNA, from single cells to a microgram of total RNA. Sequencing data from these methods show that important parameters such as GC content, gene body coverage and gene expression correlation remain consistent across input amounts. As a result, these methods have increased sensitivity and specificity for low-abundance transcripts, and reduced PCR duplicates and sequence bias, delivering high quality data.
    Combined, these advances enable higher performance with lower inputs, and overall a wider range of sample types and qualities.

  • 成璐

    格诺生物科技(中国)有限公司 | 首席医学官

    1999年毕业于华东理工大学生物化学专业,2001进入复旦大学遗传所,师从卢大儒教授并获遗传学博士学位。2006年开始在中科院上海生化细胞所进行博士后研究,主要方向为胚胎干细胞多能性维持及定向分化机制研究及多物种iPS细胞构建。2011年加入复旦大学医学院,从事多能干细胞及肿瘤的表观遗传机制研究。2017年加入鹍远基因,负责基于NGS的肿瘤基因检测相关科研项目。2018年加入格诺生物,担任医学总监,负责基于CTC及ctDNA的肿瘤临床应用研究。

    基于CTC的单细胞测序数据分享及应用展望

    与人类疾病研究从基因组到转录组、蛋白组再到表观组学的轨迹类似,单细胞研究也从早期的基因组和转录组测序快速向表观基因组研究推进,发展了scChIP-seq、scATAC-seq和scHi-C等一系列单细胞表观研究技术和scCOOL-seq等单细胞多组学技术。肿瘤循环细胞CTC是液体活检的重要类型,相对于ctDNA,CTC具有完整的细胞结构和相应的各项细胞特征。天然的单细胞存在形式使其成为单细胞测序研究的良好材料。基于高通量测序和单细胞组学的快速发展,CTC在肿瘤发生发展、肿瘤进化、肿瘤转移调控机制等基础及临床研究方面的应用前景更为广阔,但CTC鉴定及分离捕获的标准及技术瓶颈仍有待突破。我们将介绍格诺生物基于已有的CTC高效无损分离技术建立的高通量单细胞转录组测序平台及前期数据;基于CTC的单细胞测序研究进展及应用展望。

  • 亓立峰

    无锡纳奥生物医药有限公司 | 董事长

    华盛顿大学博士后,同济大学医学院研究员,博士生导师。已在国际权威期刊JACS、ACS nano、Biomacromolecules、Journal Material Chemistry、European Journal of Cancer.等杂志发表SCI科研论文20余篇,论文多次被美国癌症研究所重点报道,被引用2000余次,申请及授权国际国内发明专利8项。

    CTC液体活检与伴随诊断一体化临床应用进展
  • 黄健

    上海交通大学系统生物医学研究院 | 教授

    学习经历:
    • 1984-1987,江苏省卫生学校,医学检验;
    • 1993-1997,江苏徐州医学院,临床医疗;
    • 2000-2003, 江苏徐州医学院(硕士研究生),肿瘤学;
    • 2004-2007, 复旦大学(博士研究生),分析化学。
    • 2007-2009,上海交通大学(博士后),肿瘤基因组学和分子遗传学
    工作经历:
    • 1987.09-1995.06 徐州医学附属医院检验科,医学检验师;
    • 1995.07-1997.10 徐州医学附属医院医务科,主管检验师;
    • 1997.11-2000.09 徐州医学附属医院中心实验室,主管检验师;
    • 2001.02-2009.11 国家人类基因组南方研究中心,课题组长;
    • 2009.11-2011.06 深圳华大基因研究院健康事业研发部主任;
    2011.06-2015.05 生物芯片上海国家工程研究中心肿瘤基因组学转化应用研究室主任;
    • 2011.06-至今 国家人类基因组南方研究中心/肿瘤基因组学课题/PI/研究员;
    • 2015.06-至今 上海交通大学系统生物医学研究院/肿瘤基因组学课题组/PI/研究员。
    人才奖项:
    上海优秀技术学科带头人
    研究方向:分子遗传学和肿瘤基因组学基础和应用研究:
    利用基因芯片和高通量测序技术及生物信息学手段,系统分析肝癌基因组、转录组和甲基化组的变异,并探讨各种变异与临床特征的关联性,结合细胞学和动物学技术识别鉴定与肿瘤相关的重要功能基因,深入研究其在肿瘤发生发展中的分子机制,为肿瘤的临床诊断提供新的指标,或为最终治愈肿瘤提供潜在的药物靶点。

    高通量测序技术在单细胞组学分析与应用

参会注册Attendee Registration:

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